Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EtfaQ99LC5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EtfaQ99LC5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms