Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms