Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx18Q91ZR2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx18Q91ZR2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms