Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms