Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rprd1aQ8VDS4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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