Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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GcaQ8VC88 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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GcaQ8VC88 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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GcaQ8VC88 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms