Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms