Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsl1Q8K305 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms