Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms