Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp2Q8CGR7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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