Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim35Q8C006 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim35Q8C006 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim35Q8C006 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim35Q8C006 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim35Q8C006 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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