Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam53cQ8BXQ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam53cQ8BXQ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms