Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms