Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bnc2Q8BMQ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc2Q8BMQ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms