Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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