Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc27Q80YS5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc27Q80YS5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc27Q80YS5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc27Q80YS5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrc27Q80YS5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc27Q80YS5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lrrc27Q80YS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms