Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stk40Q7TNL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stk40Q7TNL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Stk40Q7TNL3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stk40Q7TNL3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms