Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RfflQ6ZQM0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms