Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms