Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc66Q6NS45 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc66Q6NS45 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms