Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms