Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna3Q65CL1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms