Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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