Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tbr1Q64336 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tbr1Q64336 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tbr1Q64336 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tbr1Q64336 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tbr1Q64336 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tbr1Q64336 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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