Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aebp1Q640N1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aebp1Q640N1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms