Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PatjQ63ZW7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PatjQ63ZW7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms