Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms