Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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