Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms