Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms