Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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