Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms