Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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