Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms