Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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