Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Prdm6Q3UZD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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