Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms