Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms