Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms