Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc2Q3SXD3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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