Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms