Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b1Q148W0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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