Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdx4Q07424 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms