Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms