Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc2Q05020 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms