Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NyxP83503 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NyxP83503 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NyxP83503 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NyxP83503 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms