Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx2P81066 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms