Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tp53bp1P70399 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tp53bp1P70399 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms