Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnnP61807 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnnP61807 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnnP61807 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnnP61807 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms