Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ActbP60710 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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